Vinafco là công ty cổ phần, hoạt đông theo Luật Doanh nghiệp Việt Nam. Tổ chức điều hành của công ty được cơ cấu theo mô hình công ty mẹ-con, với ban Tổng Giám đốc điều hành- Các phòng ban chức năng- Các Chi Nhánh- Hệ thống công ty TNHH do Vinafco sở hữu và các công ty cổ phần có vốn góp chi phối của Vinafco.

Cơ cấu tổ chức đảm bảo cho hoạt động điều hành, quản trị Công ty được triển khai thuận tiện, xuyên suốt, có phân cấp, phân quyền rõ ràng, tạo cơ chế chủ động và giúp tập trung nguồn lực, sức mạnh của cơ sở vật chất, con người đồng thời kết nối, hỗ trợ giữa các công ty thành viên cùng thực hiện mục tiêu kinh doanh cốt lõi và chiến lược: Cung cấp các dịch vụ logistics và chuỗi cung ứng chất lượng cao.

Ông Trịnh Ngọc Hiến
Chức vụ: Chủ Tịch HĐQT.
Sinh năm: 1967
Trình độ chuyên môn:  Thạc sĩ ngôn ngữ ( CHLB Nga ) ; Cử nhân chuyên ngành Tài chính Bảo Hiểm (Úc – New Zealand).
Ông Trịnh Ngọc Hiến tham gia quản lý, điều hành Vinafco từ năm 2007 với vị trí Chủ tịch Hội đồng quản trị-Tổng Giám đốc.
Kết hợp kinh nghiệm gần 10 năm học tập và kinh doanh tại CHLB Nga (1985-1995) và 12 năm làm việc trên nhiều cương vị lãnh đạo, quản lý khác nhau tại tập đoàn tư vấn bảo hiểm Aon (Mỹ) (1995-2007) tại Việt Nam, Ông đã và đang đóng góp tích cực cùng Ban điều hành xây dựng và phát triển Vinafco theo các định hướng phát triển chiến lược của Hội đồng quản trị và Đại hội đồng cổ đông

Ông Dương Đức Tặng.
Chức vụ: Phó Tổng Giám đốc thứ nhất.
Sinh năm 1953

 Trình độ chuyên môn: Cử nhân kinh tế-Đại học Kinh tế quốc dân Hà nội.

Ông Dương Đức Tặng với hơn 20 năm kinh nghiệm trong lĩnh vực vận tải, dịch vụ vận tải, dịch vụ logistics cùng với kinh nghiệm quản lý ở nhiều vị trí khác nhau: Giám đốc công ty Vận tải biển Vinafco, Công ty Thương mại và dịch vụ Vinafco;Công ty Tiếp vận Vinafco; Phó Tổng giám đốc công ty liên doanh Draco ( Công ty liên doanh giữa Vinafco và đối tác Nhật Bản ), hiện là Phó Tổng Giám đốc thứ nhất công ty cổ phần Vinafco. Ông là người gắn bó và đóng góp nhiều công sức trong hoạt động sản xuất kinh doanh, hướng dẫn, đào tạo đội ngũ cán bộ kế cận trong suốt quá trình hình thành và phát triển của Vinafco ngày nay./.

Hơn 10 năm kinh nghiệm tổ chức kinh doanh các dịch vụ logistics, Ông Bùi Tường Hiếu am hiểu và nhiều kinh nghiệm trong lĩnh vực tổ chức các dịch vụ 3PL,5PL, dịch vụ vận tải, phân phối hàng hoá, kho bãi...Trong thời gian làm việc tại Vinafco, trải qua các vị trí: Trưởng Trung tâm Tiếp vận Bạch Đằng;Phó Giám đốc công ty TNHH Tiếp vận VINAFCO, Phó Tổng Giám đốc công ty Vinafco.
Ông đã và đang cùng các CBNV công ty đóng góp nhiệt huyết, tài năng, kinh nghiệm để phát triển sản xuất kinh doanh, nâng cao chất lượng dịch vụ, xây dựng và phát triển Vinafco.

Tích lũy kinh nghiệm từ nhiều năm làm việc tại các công ty đa quốc gia về dịch vụ logistics, Ông Andrew Hulse là một chuyên gia giỏi về tổ chức, triển khai xây dựng hệ thống, các chuẩn mực quốc tế về kho hàng, vận tải phân phối, các dịch vụ logistics khác.
Hơn 10 năm với các vị trí quản lý, điều hành, quản trị chuỗi cung ứng logistics cho các công ty nước ngoài, công ty liên doanh tại Việt Nam , hiện nay Ông đang cùng với các thành viên ban Tổng Giám đốc, các CBNV Vinafco triển khai xây dựng, áp dụng thực hiện các chuẩn mực quốc tế về hoạt động logistics tại Vinafco, góp phần thực hiện chiến lược phát triển Vinafco thành công ty hàng đầu Việt Nam trong hoạt động logistics trong những năm tới.

Từng làm việc ở các đơn vị: Intimex, Công ty Digiland- Singapo, Công ty cổ phần thương mại đầu tư HB với các vị trí Trưởng phòng kế toán, kế toán trưởng, phó giám đốc công ty cổ phần thương mại đầu tư HB ....Bà Nguyễn Thị Minh Thuần tham gia nhiều nhiệm kỳ ban kiểm soát của Vinafco, đóng góp nhiều kinh nghiệm của mình trong hoạt động kiểm soát doanh nghiệp